Film X-Men Origins: Wolverine yang diproduksi oleh Marvel ini membawa penonton kembali ke masa lalu untuk menyaksikan kisah kelam dan penuh aksi dari salah satu karakter mutant paling ikonik, Wolverine. Film ini, yang merupakan bagian dari franchise X-Men, menggali lebih dalam tentang asal-usul Wolverine, atau yang dulunya dikenal sebagai James Howlett, dan hubungannya yang kompleks dengan saudara tirinya, Victor Creed.
Kisah dimulai pada tahun 1845, di mana James muda menyaksikan sebuah tragedi mengerikan: kematian ayahnya di tangan penjaga tanah bernama Thomas Logan. Dalam kemarahan dan kesedihan yang mendalam, mutasi James aktif untuk pertama kalinya. Cakar tulang mencuat dari buku-buku jarinya, dan tanpa sengaja ia menusuk Thomas Logan hingga tewas. Saat sekarat, Thomas mengungkapkan sebuah rahasia mengejutkan bahwa ia adalah ayah kandung James. Trauma ini memaksa James melarikan diri bersama Victor Creed, anak Thomas yang lain dan juga saudara tiri James. Victor sendiri telah menunjukkan tanda-tanda mutasi berupa kuku-kuku tajam dan kemampuan penyembuhan diri yang luar biasa, mirip dengan James.
Kedua bersaudara ini menghabiskan satu abad berikutnya terlibat dalam berbagai medan perang bersejarah, mulai dari Perang Saudara Amerika, Perang Dunia I dan II, hingga Perang Vietnam. Di Vietnam, sifat Victor yang semakin brutal dan tak terkendali mencapai puncaknya ketika ia mencoba melakukan kekerasan seksual pada seorang wanita Vietnam dan membunuh seorang perwira senior yang berusaha menghentikannya. James, yang selalu berusaha melindungi Victor, ikut terlibat dalam insiden tersebut. Keduanya dijatuhi hukuman mati oleh regu tembak, namun keajaiban mutasi mereka menyelamatkan nyawa mereka.
Di sinilah Major William Stryker muncul, menawarkan mereka kesempatan untuk bergabung dengan Team X, sebuah tim khusus yang beranggotakan para mutant dengan kemampuan unik. Tim ini terdiri dari Agent Zero, seorang penembak jitu; Wade Wilson, seorang tentara bayaran ahli pedang katana; John Wraith, yang memiliki kemampuan teleportasi; Fred Dukes, mutant super kuat dan kebal; serta Chris Bradley, seorang teknopat. James, yang kini menggunakan nama Logan, menerima tawaran Stryker. Namun, seiring berjalannya waktu, Logan semakin tidak nyaman dengan kekerasan dan kurangnya empati yang ditunjukkan Victor dan sebagian anggota tim. Akhirnya, ia memutuskan untuk meninggalkan Team X dan mencari jalan hidup yang berbeda.
Enam tahun kemudian, Logan hidup tenang sebagai penebang kayu di Kanada bersama kekasihnya, Kayla Silverfox. Kehidupan damai ini kembali terusik ketika Stryker dan Zero muncul kembali. Mereka mengklaim bahwa Wade dan Bradley telah tewas dan seseorang sedang memburu mantan anggota Team X. Logan menolak untuk bergabung kembali dengan Stryker. Namun, segalanya berubah ketika ia menemukan Kayla terbunuh di hutan. Logan menyadari bahwa Victor adalah orang yang bertanggung jawab. Ia mencari Victor dan mencoba melawannya, namun kalah telak.
Stryker kembali mendekati Logan dan menawarkan cara untuk membuatnya cukup kuat untuk membalas dendam pada Victor. Logan setuju dan menjalani operasi mengerikan untuk melapisi kerangkanya dengan adamantium, logam terkuat di dunia. Namun, Logan mendengar rencana Stryker untuk menghapus ingatannya dan menjadikannya senjata pribadi. Ia melarikan diri dan berlindung di sebuah pertanian milik pasangan lansia yang baik hati. Sayangnya, Zero menemukan mereka dan membunuh pasangan tersebut. Dalam pertempuran sengit, Logan berhasil menjatuhkan helikopter Zero, dan sebelum Zero menghembuskan nafas terakhir, Logan bersumpah akan membalas dendam pada Stryker dan Victor.
Pencarian Logan membawanya ke Las Vegas, di mana ia menemukan Wraith dan Dukes di sebuah gym tinju. Dukes, yang kini bertubuh gemuk karena gangguan makan akibat rasa bersalah, mengungkapkan bahwa Victor masih bekerja untuk Stryker, memburu mutant untuk dijadikan percobaan di laboratorium rahasia Stryker yang terletak di sebuah tempat bernama “The Island”. Dukes juga menyebutkan nama Remy “Gambit” LeBeau, satu-satunya mutant yang berhasil kabur dari pulau tersebut dan mengetahui lokasinya. Wraith dan Logan berhasil menemukan Gambit di New Orleans. Setelah membantu Gambit melawan Victor yang tiba-tiba muncul dan membunuh Wraith untuk mengambil DNA-nya, Gambit setuju membantu Logan membebaskan para mutant yang ditawan Stryker.
Gambit membawa Logan ke fasilitas Stryker di Three Mile Island. Di sana, Logan menemukan fakta pahit bahwa Kayla masih hidup dan dipaksa Stryker untuk memata-matai Logan sebagai imbalan atas keselamatan adiknya. Stryker mengingkari janjinya untuk membebaskan adik Kayla dan menolak memberikan lapisan adamantium kepada Victor, dengan alasan hasil tes menunjukkan Victor tidak akan selamat dari proses tersebut. Stryker kemudian mengaktifkan Wade Wilson, yang kini telah berubah menjadi Weapon XI, “pembunuh mutant” dengan kekuatan gabungan dari berbagai mutant.
Saat Logan dan Victor bekerja sama untuk melawan Weapon XI, Kayla terluka parah saat membantu para mutant tawanan melarikan diri menuju tempat aman bersama Professor Charles Xavier. Setelah Logan berhasil mengalahkan Weapon XI, Stryker muncul dan menembak kepala Logan dengan peluru adamantium, membuatnya pingsan dan kehilangan ingatan. Sebelum Stryker dapat menembak Kayla, Kayla menggunakan kekuatan mutannya untuk memerintahkan Stryker berbalik dan berjalan menjauh hingga kakinya berdarah, sebelum akhirnya meninggal dunia karena luka-lukanya.
Logan terbangun dalam keadaan amnesia. Ia menemukan kalung anjingnya bertuliskan “Logan” di satu sisi dan “Wolverine” di sisi lainnya. Ia melihat tubuh Kayla, namun tidak mengenalinya.
Dalam adegan mid-credits, Stryker ditahan oleh Polisi Militer terkait pembunuhan Jenderal Munson, yang ia lakukan untuk melindungi eksperimennya. Dalam adegan post-credits, tangan Weapon XI terlihat merangkak keluar dari reruntuhan dan menyentuh kepalanya yang masih hidup, mengisyaratkan bahwa ia belum sepenuhnya mati.
