Film Spider-Man: Far From Home dari Marvel Cinematic Universe (MCU) membawa Peter Parker alias Spider-Man dalam petualangan yang jauh dari lingkungan rumahnya di New York. Setelah peristiwa dahsyat yang melibatkan Thanos dan kehilangan mentornya, Tony Stark, Peter berusaha untuk kembali menjalani kehidupan normal sebagai remaja. Ia sangat bersemangat untuk mengikuti liburan sekolah musim panas ke Eropa bersama teman-teman sekelasnya, dengan harapan dapat mengungkapkan perasaannya kepada MJ, teman sekelas yang menarik perhatiannya.
Namun, rencana Peter untuk menikmati liburan santai terganggu ketika Nick Fury dan Maria Hill muncul. Mereka sedang menyelidiki serangkaian serangan makhluk elemental yang misterius. Di tengah kekacauan badai aneh di Meksiko, mereka bertemu dengan Quentin Beck, individu berkekuatan super yang tiba-tiba muncul dan berhasil mengalahkan Earth Elemental. Fury dan Hill, yang sedang mencari bantuan untuk menghadapi ancaman ini, merekrut Beck.
Sementara itu, di New York, sekolah Peter, Midtown School of Science and Technology, akhirnya menyelesaikan tahun ajaran yang sempat diulang karena peristiwa “Blip” – kembalinya siswa yang menghilang selama lima tahun akibat tindakan Thanos. Sekolah kemudian mengadakan perjalanan musim panas ke Eropa. Peter, yang masih berduka atas kepergian Tony Stark dan berusaha menghindari panggilan dari Happy Hogan yang menyampaikan pesan Fury, tetap fokus pada liburannya.
Setibanya di Venice, Italia, liburan mereka kembali diinterupsi. Kali ini, Water Elemental menyerang kota. Peter, yang secara naluriah bertindak sebagai Spider-Man untuk melindungi teman-temannya, menyaksikan kedatangan Beck yang kembali tampil sebagai pahlawan dan berhasil mengalahkan makhluk air tersebut. Fury akhirnya berhasil menemui Peter dan memberinya kacamata peninggalan Tony Stark. Kacamata tersebut ternyata adalah kunci untuk mengakses E.D.I.T.H. (Even Dead, I’m The Hero), sebuah sistem kecerdasan buatan yang mengendalikan database Stark Industries dan memiliki akses ke persenjataan satelit orbital yang canggih.
Beck menjelaskan bahwa ia berasal dari realitas alternatif di dalam multiverse, di mana keempat Elemental telah menghancurkan dunianya dan membunuh keluarganya. Ia memprediksi bahwa Fire Elemental akan menyerang Prague, Czech Republic. Peter, yang merasa tidak siap untuk tanggung jawab sebesar ini dan masih ingin menikmati liburannya, awalnya menolak ajakan Fury untuk bergabung. Namun, Fury dengan cerdik mengatur ulang rencana perjalanan sekolah agar mereka menuju Prague.
Di Prague, Peter terpaksa membantu Beck melawan Fire Elemental untuk melindungi teman-temannya sekali lagi. Dengan bantuan Peter, Beck berhasil mengalahkan makhluk tersebut. Fury dan Hill kemudian mengundang Peter dan Beck ke Berlin, Jerman, untuk membahas pembentukan tim superhero baru. Peter, yang merasa Beck lebih pantas dan berpengalaman, memutuskan untuk menyerahkan kendali E.D.I.T.H. kepada Beck dan mundur.
Namun, di balik layar, terungkap bahwa Beck bukanlah pahlawan dari dimensi lain seperti yang ia klaim. Ia adalah mantan spesialis ilusi holografik di Stark Industries yang dipecat karena sifatnya yang tidak stabil. Bersama dengan mantan karyawan Stark lainnya, Beck menggunakan teknologi proyeksi canggih untuk menciptakan ilusi kekuatannya dan Elemental. Ia berencana menggunakan E.D.I.T.H. dan persenjataan dronenya untuk meningkatkan skala ilusinya dan memanipulasi dunia agar menganggapnya sebagai pahlawan setara Avenger.
Ketika MJ mengetahui identitas rahasia Peter sebagai Spider-Man, mereka menemukan serpihan puing proyektor dari pertempuran melawan Fire Elemental. Keduanya menyadari bahwa Beck telah menipu mereka. Peter segera menuju Berlin untuk memperingatkan Fury, namun ia terjebak dalam ilusi rumit Beck. Beck mengungkapkan nama-nama teman Peter yang mengetahui rencananya sebelum kemudian Peter tertabrak kereta. Meskipun terluka, Peter selamat.
Di Belanda, Peter menghubungi Hogan dan memintanya untuk membawanya ke London, tempat teman-temannya berada. Beck, menggunakan E.D.I.T.H., mengorkestrasi penggabungan semua Elemental untuk menciptakan serangan ilusi skala besar di London. Ia berencana untuk membunuh teman-teman Peter dalam serangan yang diskenario ini, karena khawatir mereka akan membongkar penipuannya. Peter berhasil mengacaukan ilusi Beck dan dalam kemarahannya, Beck menyerang Peter dengan drone. Peter berhasil merebut kembali kendali E.D.I.T.H. dan mengalahkan Beck, yang akhirnya terkena tembakan nyasar dari salah satu drone-nya sendiri. Sebelum meninggal, Beck memerintahkan salah satu rekannya untuk mengambil data dari drone.
Setelah kembali ke New York, Peter dan MJ memulai hubungan romantis. Namun, ketenangan mereka tidak berlangsung lama. Dalam adegan mid-credits, J. Jonah Jameson dari TheDailyBugle.net menyiarkan video hasil manipulasi kejadian di London. Video tersebut memfitnah Spider-Man sebagai dalang serangan drone dan kematian Beck, sekaligus membongkar identitas rahasia Spider-Man kepada dunia. Di adegan post-credits, terungkap bahwa Fury dan Hill yang berinteraksi dengan Peter sebenarnya adalah Skrull bernama Talos dan Soren yang sedang menyamar, atas perintah Fury yang sebenarnya, yang sedang berada di luar angkasa memimpin kelompok Skrull.
