Film John Wick: Chapter 2 melanjutkan kisah John Wick, seorang mantan pembunuh bayaran legendaris yang berusaha menjalani kehidupan tenang setelah pensiun. Namun, ketenangannya terusik ketika ia didatangi oleh Santino D’Antonio, seorang bos kejahatan Camorra. Santino menuntut John untuk melunasi “marker” (medalion yang menandakan sumpah darah) yang pernah ia buat dengannya. Santino telah membantu John menyelesaikan “tugas mustahil” yang memungkinkannya pensiun dan menikahi Helen, jadi dia berhutang budi.
John, yang enggan kembali ke dunia gelap, menolak. Santino marah dan menghancurkan rumah John dengan peluncur granat. Setelah selamat dari serangan tersebut, John terpaksa menerima permintaan Santino demi menghindari hukuman mati karena melanggar janjinya. Santino menugaskan John untuk membunuh saudara perempuannya sendiri, Gianna D’Antonio, agar Santino dapat merebut posisinya di “High Table,” sebuah dewan yang terdiri dari dua belas bos kejahatan tingkat tinggi di dunia bawah. Santino juga mengirim Ares, pengawal pribadinya yang bisu, untuk mengawasi John.
John melakukan perjalanan ke Roma dan berhasil menyusup ke upacara penobatan Gianna. Menyadari bahwa kematiannya tak terhindarkan, Gianna memilih untuk mengakhiri hidupnya sendiri dengan memotong nadinya. John kemudian menembak kepalanya untuk mengakhiri penderitaannya dan memenuhi kewajibannya kepada Santino. Saat hendak meninggalkan lokasi, John diserang oleh Cassian, pengawal Gianna, yang memaksanya melarikan diri ke katakombe terdekat. Di sana, ia dikhianati oleh Ares yang bermaksud membunuhnya untuk menutupi jejak Santino.
Setelah membunuh sebagian besar anak buah Ares, John kembali dikejar oleh Cassian. Pertarungan sengit terjadi hingga mereka mencapai Continental Roma, tempat mereka dilarang “melakukan bisnis”. John menjelaskan bahwa ia terpaksa membunuh Gianna karena marker yang dipegangnya. Cassian memahami situasi John, namun tetap merasa harus membalas dendam atas kematian Gianna, meskipun ia berjanji akan memberikan John kematian yang cepat.
Julius, manajer Continental Roma, membantu John kembali ke New York dengan aman. Santino, yang telah mengeluarkan kontrak pembunuhan atas John dengan dalih membalas dendam atas kematian saudara perempuannya, membuat John menjadi target bagi para pembunuh bayaran di seluruh kota. Winston, pemilik Continental New York, mengunjungi Santino dan mengonfirmasi bahwa marker telah dilunasi, sehingga John tidak lagi terikat untuk mematuhi atau menyakiti Santino.
Di kereta bawah tanah New York, John bertemu dengan Cassian dan terlibat dalam pertarungan brutal yang berakhir dengan Cassian ditusuk di aorta dan ditinggalkan dalam keadaan kritis. John yang terluka parah mencari bantuan dari “Bowery King,” seorang bos kejahatan bawah tanah. Tertarik dengan niat John untuk membunuh anggota High Table, Bowery King memberinya pistol Kimber M1911 dengan tujuh peluru, yang masing-masing bernilai satu juta dolar dari kontrak pembunuhan Santino. Ia juga mengarahkan John ke sebuah museum seni tempat Santino mengadakan pesta gala.
John menyerbu museum tersebut dan membunuh semua anak buah Santino, termasuk Ares. Santino berhasil melarikan diri ke Continental, tempat ia merasa aman karena Continental adalah zona netral. Meskipun Winston memperingatkan untuk tidak bertindak gegabah, John dengan berani mengeksekusi Santino di lobi Continental.
Keesokan harinya, Winston bertemu dengan John dan menjelaskan bahwa Camorra telah melipatgandakan hadiah untuk kepalanya, menawarkannya secara global. Selain itu, karena “melakukan bisnis” di wilayah Continental, John dinyatakan excommunicado, kehilangan semua hak dan akses ke sumber daya dunia kejahatan. Namun, karena persahabatan mereka, Winston menunda status excommunicado selama satu jam dan memberinya marker untuk digunakan di masa depan.
Saat John pergi, Winston secara resmi memulai proses kontrak excommunicado, yang akan aktif dalam satu jam. Ketegangan meningkat, John mulai berlari saat telepon di sekitarnya mulai berdering secara massal. Babak baru dalam pelarian hidup John Wick dimulai.