Inti cerita La Querida terbagi dalam dua alur yang saling terkait oleh tema perselingkuhan dan cinta terlarang. Alur pertama memperkenalkan sepasang kekasih muda yang dimabuk asmara. Romansa mereka begitu intens, penuh gairah, seolah dunia hanya milik berdua. Namun, kebahagiaan itu mendadak hancur berkeping-keping ketika sang pria mengetahui sebuah fakta mengejutkan: wanita yang begitu dicintainya ternyata sudah berstatus istri orang. Pergolakan batin dan keputusan sulit pun harus dihadapi, mengakhiri kisah cinta yang baru saja mekar karena tembok sakral pernikahan yang tak bisa ditembus.
Sementara itu di sisi lain, film ini juga menyorot kehidupan seorang suami yang terjebak dalam pernikahan tanpa kebahagiaan. Rasa hampa dan kesepian perlahan menggerogoti jiwanya. Dalam pencariannya akan penghiburan, ia bertemu dengan seorang guru yang juga menyimpan luka dan rasa sepi yang tersembunyi. Pertemuan tak disengaja ini perlahan menumbuhkan benih-benih perasaan yang terlarang, mengarah pada sebuah hubungan gelap yang penuh risiko namun menawarkan secercah ‘kenyamanan’ yang tak ia temukan dalam rumah tangganya sendiri. Mereka menemukan pelukan dan pengertian di antara satu sama lain, di balik tirai kerahasiaan yang mencekam.
